maven2で参照ライブラリjarの中身を含む実行用jarファイルを作るには

まずpom.xmlに下記みたいなエレメントの記述を追加して

<project> 
  ...
  <build>
    ...
    <plugins>
      ...
      <plugin>
        <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
        <artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId>
        <configuration>
          <archive>
            <manifest>
              <mainClass>(起動クラスのパッケージ名を含むフルネーム)</mainClass>
            </manifest>
          </archive>
        </configuration>
      </plugin>
    </plugins>
  </build>
</project>

コマンドライン

mvn assembly:assembly -DdescriptorId=jar-with-dependencies

ただし参照ライブラリはすべてmavenリポジトリにインストール済みであること